Historia - Nowe tysiąclecie

Nowe tysiąclecie rozpoczęło się od serii sukcesów. Po ukończeniu Bundesligi dwukrotnie w czołówce, celem stał się tytuł mistrzowski w sezonie 1999/2000.

Tytuł był na wyciągnięcie ręki. Bayer w tym sezonie zanotował swoje najwyższe zwycięstwo w historii pokonując SSV Ulm 1846 aż 9:1.

Przed ostatnią kolejką Bayer miał trzy punkty przewagi nad Bayernem Monachium. Wystarczyło zremisować w meczu z Unterhaching. Niestety piłkarze z Leverkusen przegrali, bezpośredni rywal w walce o tytuł wygrał i to zawodnicy z Monachium zdobyli „majstra”.

W sezonie 2001/2002 Bayer 04 był bliski zdobycia trzech trofeów, a niestety nie zdobył żadnego. W lidze o punkt, wówczas podopiecznych Klausa Toppmöllera, wyprzedziła Borussia Dortmund. Z kolei w finale Pucharu Niemiec lepsze okazało się Schalke, wygrywając 4:2.

Najbardziej szkoda jednak przegranej w Lidze Mistrzów. Po fantastycznej przygodzie, wyeliminowaniu Manchesteru United, Liverpoolu, zwycięstwach z Juventusem, Lyonem, Deportivo, Barceloną - Bayer dopiero w wielkim finale na stadionie w Glasgow zatrzymał Real Madryt, wygrywając po niezwykle dramatycznym meczu 2:1. Bramkę w tym finale dla podopiecznych Klausa Toppmollera zdobył Lucio.

Skład Bayeru z finału Champions League:

Hans-Jörg Butt – Zoltan Sebescen (65 Ulf Kirsten), Boris Živković, Lúcio (90+1 Marko Babić), Diego Rodolfo Placente - Bernd Schneider, Carsten Ramelow (kapitan), Yildiray Bastürk, Michael Ballack - Oliver Neuville, Thomas Brdarić (39 Dimitar Berbatow).

W następnym sezonie, drużynę opuściło kilku zawodników, a Bayer dopiero w ostatniej kolejce, zwycięstwem z Norymbergą zapewnił sobie utrzymanie w Bundeslidze.

W sezonie 2004/2005, Reiner Calmund zrezygnował ze stanowiska dyrektora sportowego ze względu na kłopoty zdrowotne. To jednak w tych latach, Bayer pod wodzą Klausa Augenthalera, ponownie przypomniał o sobie w Europie, gdy w Lidze Mistrzów zrewanżował się Realowi, pokonując tę ekipę na BayArenie aż 3:0, a cała nasza drużyna otrzymała od prasy ocenę "1" za ten mecz, czyli klasa światowa.

Ostatecznie, Aptekarze dotarli do 1/8 rozgrywek, zatrzymani przez Liverpool. Po drodze odnieśli jednak zwycięstwa nad Romą, Dynamem Kijów, a motorem napędowym zespołu był Jacek Krzynówek i fantastyczny duet napastników: Berbatow - Franca.

W kolejnych latach Bayer miał problem by uplasować się na podium Bundesligi, mimo tego, dwa razy pod rząd w sezonach 2006/2007 i 2007/2008 dotarł do ćwierćfinału Pucharu UEFA. Ponownie bliski wywalczenia sukcesu Bayer był w sezonie 2008/2009, gdy dotarł do finału Pucharu Niemiec, ulegając tam jednak 0:1 Werderowi.

Równie udany sezon Bayer miał rok później, gdy wywalczył tytuł mistrza jesieni i ustanowił rekord Bundesligi, nie przegrywając 24 spotkań od początku sezonu. Mimo tego, po słabszej końcówce sezonu, Aptekarze zajęli 4 miejsce.

Kolejny sezon, ten najświeższy, ponownie przyniósł wielki sukces, jakim było piąte już wicemistrzostwo Niemiec drużyny prowadzonej przez Juppa Heynckesa.

W między czasie, rozbudowano także BayArenę, która od sierpnia 2009 może pomieścić 30 210 widzów. Gruntownemu remontowi uległ także boczny stadion Ulrich-Haberland Stadion.

Tymczasem Bayer przejął trener Robin Dutt, który z drużyną Aptekarzy po sześciu latach ponownie zagra w Lidze Mistrzów.